Basic Local Alignment Search Tool（BLAST）
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Basic Local Alignment Search Tool（BLAST）

BLAST是生物信息学中非常重要的工具，它通过将DNA或蛋白质序列与公开数据库中的序列进行比对，来找到相似的序列。该过程基于序列相似性原理，可以用于推断序列之间的功能和进化关系，以及帮助鉴定基因。

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详细信息

国家：美国

NCBI的BLAST提供了多种搜索子程序，以适应不同的研究需求：

  • BLASTP：用于查询蛋白质序列与蛋白质数据库的比对，适用于已知蛋白质序列寻找同源蛋白或者功能相似的蛋白。
  • BLASTN：用于查询核酸序列及其互补序列与核酸数据库的比对，适用于核酸序列的同源性搜索。
  • BLASTX：用于将核酸序列翻译后与蛋白质数据库进行比对，适用于当研究者只有核酸序列但想探索可能的蛋白质编码信息时。
  • TBLASTN：用于查询蛋白质序列与核酸数据库的比对，但比对时会将核酸数据库中的序列翻译成六个阅读框的蛋白质序列后进行比对。
  • TBLASTX：用于查询核酸序列与核酸数据库的比对，但比对时会将查询的核酸序列和数据库中的核酸序列都翻译成蛋白质序列后进行比对。

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